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如果不小心删除了iPhone上的短信应用图标，可以尝试以下几种方法来恢复。
1、App Store重新下载：可以打开App Store，在搜索框中输入“短信”并确认，找到短信应用重新下载安装。
2、从备份恢复：如果之前有使用iTunes或iCloud备份手机数据，可以通过恢复备份的方式来找回短信应用，连接iPhone到电脑，打开iTunes并选择设备，在“恢复备份”选项中选取最近的备份文件来恢复应用和数据。
3、使用第三方应用：可以在App Store中搜索一些第三方应用，如“快捷恢复精灵”等，这些应用可以帮助找回被删除的iPhone应用图标，但请注意选择可信赖的应用，并确保从正规渠道下载。
如果以上方法都不奏效，可能是系统存在问题导致应用图标异常消失，在这种情况下，可以尝试重启手机或更新系统来解决，如果问题仍然存在，建议咨询苹果官方客服或前往附近的苹果专卖店寻求帮助，在操作任何恢复数据时，确保数据的备份以防万一。